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地下都市的一间咖啡厅里，明日香跟真嗣坐在窗边的位子。透过玻璃幕墙，可见外面的人造夕阳美景。
明日香仔细打量着面目一新的真嗣，因为此时的真嗣白发红瞳，肤色雪白如反光板成精。这让她有些不舒服，因为这些是绫波的特征。
她像食肉动物一般，盯着真嗣的眼睛，“你是从哪里冒出来的？怎么证明你是……”
真嗣把手背在后脑勺，“你睡觉喜欢踢被子，最害怕打雷，屁股还被蛤蟆咬过……”
“够了！”明日香猛地一拍桌子，脸色发紫。这是她人生中，不堪回忆的污点之一。
如果有一种药能抹除这段记忆，她一定会不择手段对知情者下药。
明日香皱眉道：“我记得 NERV 有一种技术，可以植入特定的记忆。”
真嗣解释道：“那仅限于语义记忆，也就是语言技能和一般知识。还有 20%记忆丢失的缺陷，没法做到读取你密码这种精细活。你应该接触过我的克隆体，他给你的感觉是什么样的？”
“嗯……”
明日香低头思考了一会儿，“没你这么油腔滑调，和欠揍。”
“没错，又呆又傻。现在的我，”真嗣拍拍胸口，“还是原来的配方对吧。”
“如果他被使徒控制了，那么以他驾驶初号机时掌握的力量，他想做什么，谁也无法阻止他。连 SEELE 所谓‘真正的EVA’—— 也不行。”美里忽然出现，端着一杯咖啡走过来，绫波则默默跟在她身后。
美里继续解释道：“真嗣是从初号机的核心中出来的，虽然指纹和血型，甚至 DNA 也发生了变异。但通过冬月老师留下的技术，可以检测生命图谱来确认生命的本质，或者说类似意识和灵魂的印记，无法改变。”
接着，她又将真嗣的奇妙遭遇解释了一遍。显然，她只说了一部分实话。真嗣在她体内寄生这件事没有提及，原因十分复杂。真嗣当然不想戳破这点，毕竟不想自找麻烦。较真的话，难道以后要他叫美里妈妈？
“这个技术可靠吗？”明日香问。
美里答道：“这是源自使徒生命图样的技术，参与实验的上千个样本中，至今未发现有差错的案例。“
“是这样吗？”明日香将信将疑。
“是这样啦。明日香，我是真是假，你还不清楚吗？”真嗣“深情款款”注视着明日香，传达着自己的真诚，直到她打了一个寒战。
“别这样看我，好恶心的眼神。”明日香一脸嫌弃。
真嗣立马变成哭丧脸：“我不是变得更帅了吗，你怎么不喜欢？”
明日香看向一边的绫波：“绫波同学，你相信他是真的真嗣吗？”
“嗯。”绫波点点头。
“从哪里看出来的呢？”
“直觉。”绫波道。
“……”
“真是好骗啊。”明日香瞥了真嗣一眼。
“那么，我暂时保持怀疑态度。”明日香抱手道。
真嗣的谈吐和各种小动作，这种熟悉的死样子倒是让人放心，明日香松了一口气。对真嗣的，她暂时还有疑虑，很正常。真嗣相信通过一段时间的相处，可以打消她的怀疑。
聚会的时间很宝贵，很快明日香跟绫波就离开了，因为需要备战训练。
只有他，因为初号机，以及身份的问题，反而无所事事。
下午三点十五分左右，美里急匆匆找到真嗣。
“刚才进行的初号机同步实验，候补驾驶员疯了两个。”
真嗣一挑眉毛，“果然，初号机拒绝陌生人连接吗？”
“初号机，好像对其他人的神经同步充满敌意。”美里道。
“那是当然，初号机的自我已经半觉醒，我早就警告过你们。现在上面总该死心了吧，初号机离了我还真开不起来。”
真嗣走到玻璃幕墙边，外面的轨道正在运送着两架巨大的人形机体，涂装为朴素的军绿色，样式很陌生。
“那是什么？”
“战略自卫队使用的新型对使徒武器——四式统合机兵，代号为‘台’，陆空混合型作战武器。”
美里继续解释道：“很熟悉吧，因为吸收了 Jet Alone ，以及雷霆（兵器开发部秘密研制的超级武器，重达3000吨，拥有十万马力涡轮喷气发动机，能够适应海陆空多种战撤境。）的技术框架，甚至可以说是两种机兵的升级版。”
“难道这是上面的备用计划？”
“没错，候补驾驶员的武器其实是台，只不过有人不死心想染指EVA。现在出了事故，也就只能靠这种新型机兵了。”
真嗣从手腕拉出一块柔性屏幕，上面显示了更为详尽的资料。
台陆战时是双足步行坦克，空中机动时更为灵活。
由于核反应堆不安全，所以台配备了高输出和高稳定性的N2反应堆芯，属于最新突破的无污染绿色能源技术。
主要武器是火药式的双管机关炮，但科技含量一点也不低，因为机关炮的子弹是AT力场破防型的高爆穿甲弹。使用了SEELE的技术，原料来自最终教条区底部挖出来的生命之树残根。
由于材料珍贵，属于珍稀不可再生资源，所以弹头造价高昂，打一颗少一颗。驾驶员需要双人驾驶，以及后方支援网络提供必要的指挥。
“不得了，该来还是来了。”
真嗣就怕这个。
做人打使徒的时候，天天期待有朗基努斯之枪破防效果的超级武器。现在他能以人的形态施展AT力场，反而担心起来。
人类的科技实力，在灭世之危的压力下，呈现爆炸式的发展。
现在能够破防AT力场的常规武器已经出现了，虽然实战效果未知。但以后小型化后，普通人拿一把枪也能崩了他。
“所以还是要低调啊，苟起来……”
……
与此同时，第三东京市郊外的树林里，一位不速之客出现。
老碇在林间快速穿梭，通过探测器的死角不断接近地下 NERV 总部。武装到牙齿的都市要塞，作为曾经的人类补完委员会成员、NERV总司令，想要偷偷潜入不要太简单。毕竟所有的武器系统都是针对使徒设计的，对人类的入侵反而缺少防范。
突然，他倒地抽搐起来，发出阵阵痛呼。
果然，吞下亚当分身的幼体胚胎后，亚当的力量不是人力能够掌握的。现在调节药物也吃完了，老碇几乎陷入绝境。
这一切的根源，还是真嗣这个搅屎棍。绫波不听话了，在关键时刻坑了老碇一把，导致他的补完大计彻底失败。
他感觉身体每个细胞，每时每刻都在发生变异，逐渐侵染到所有组织器官。体表不断隆起一个个蠕动的肉瘤，血管暴突如缚身的绳索。神经似乎脱离了控制，连大脑意识也模糊起来。感觉就像一条活鱼，被针扎成刺猬，放入油锅中炸一般，生不如死。忽然一瞬间，脑海中突然闪现出某个无比强大的存在。人类孱弱的精神意识，在其面前如蝼蚁一般弱小。
“亚当，是你！”老碇喃喃道。
“你认得我？”
“你还是觉醒了。可惜，我功亏一篑。”
“原来如此，李林竟敢亵渎我的力量，你该死……”
扑哧，食指。在剧痛的刺激下，老碇逐渐挽回了自我意识。
“实在不妙，不只是身体脱离掌控，连意识也有被入侵的倾向。”老碇刷新了一次亚当的认知，原来觉醒的“神”如此可怕。
不过，人类一直在做的，就是以技术手段掌握神之力，这不算什么。
补完计划被阻止，老碇死里逃生后，现在几乎陷入了绝境。
“如果得到那个的话……”
老碇慢慢爬起来，拔出了腿上的树枝，血液喷涌而出。不过很快，伤口周围的皮肉开始蠕动，几个呼吸之间，就封口闭合了，完好如初。
“尼布甲尼撒之匙，打开大门的钥匙……”
老碇重新融入黑暗之中。