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有了皇帝的批示，徐光启和毕懋康自然不敢怠慢，先是修缮火药库，排查隐患，然后筛选内部人员，制定严格的出入制度。当然戚兴国的锦衣卫和魏进忠的东厂也没闲着，对于那些身份可疑、行迹诡异的人全部抓到诏狱严刑拷打，还真找出了一些与建虏存在利益关系的汉奸、卖国贼。
当魏进忠捧着这些供状来到勤政殿时，左战不由得倒吸一口凉气，庆幸自己提前整饬了后宫，要不然小命难保。王恭厂这么机密的地方都能混入奸细，那其他军营自不必说。
见惺帝龙颜大怒，魏进忠惯会见风使舵，趁机说道：
“主子万岁爷息怒，千万别为这些无耻小人伤了龙体。先前戚千户在关外就抓获了不少奸细，不如交予奴才加以审问，必要时可以传讯努尔哈赤等人。”
左战听闻抬头打量着魏进忠，心想你真是个天才，堪称人类有史以来最伟大的整蛊专家，顿时转怒为喜，笑着说道：
“好奴才，让你做掌刑千户真是屈才了。”
魏进忠见圣心甚悦，也跟着淫笑起来，叩头说道：
“只要能为主子万岁爷分忧，奴才愿意赴汤蹈火，粉身碎骨，那些虚名奴才并不计较。只是主子早朝晏罢，夜以继日的劳心劳神，长此下去可怎么好。”
说完魏进忠竟然一把鼻涕一把泪的哭诉起来，这让左战大感意外。说实话谁不想工作的努力被表扬，身体的健康被关心，他见魏进忠如此不免内心一热，语气温柔的说道：
“你起来回话。”
顿时勤政殿内寂静无声，只有西洋摆钟滴答作响，左战想了下说道：
“朕就是一天二十四个小时也忙不完，你看还有这么多事等着朕批示。眼下是大明朝的关键时期，新政虽然已经推行但至少要等两年才能见到成效，所以内部不能乱。你即刻接替李凤翔提督东厂，让他到司礼监先做第三秉笔太监。除了继续监视东林余孽，近期的重点是清除通敌的奸细，如果努尔哈赤真敢忤逆朕，只要证据确凿就将他绳之以法。”
平心而论李凤翔的手段真没有魏进忠狠辣果决，左战不得不放虎归山，再给魏进忠一次机会。为了避免此人过早的针对努尔哈赤一家，也防止努尔哈赤在京师收买细作，左战决定将其搬至北直隶保定府高阳县。一说到高阳县，书友们肯定就明白其中的原因。
据《明史》及民国版《高阳县志》记载，公元1638年十一月，清军大举进攻高阳。此时赋闲在家的孙承宗率族人和全城百姓坚守城门，终因寡不敌众城破被擒。面对清军的高官厚禄，他毅然选择面向京师三拜后自缢而亡，时年七十六岁。另外他的五个儿子，六个孙子，两个侄子，八个侄孙全部战死，可谓一门忠烈。
朱由检闻讯后哀伤悲叹，对他的评价是“汉则孔明，唐则裴度。旧辅孙承宗前劳难泯，死义更烈”，之后南明弘光帝朱由崧追赠太师，谥号“文忠”。
左战对孙承宗是非常推崇的，这也是为什么一开始就拜他为师，并授予少傅的头衔，非常时期又命他做蓟辽总督、兵部尚书。把努尔哈赤一家幽禁在高阳，无形中就多了一道护身符，即便将来皇太极再次反叛，左战也不会担心孙承宗一家的悲壮重演。
魏进忠走后，左战又单独召见了兵部右侍郎李邦华，此人去年调入军机处参与大明王朝的高级军事决策，他的第一项任务就是配合孙承宗整饬京营。所谓新官上任三把火，加上他有皇帝撑腰，上任之初便携天子之威改组了四卫营，革除老弱、占役、虚冒的弊端，整顿军备，严苛训练，为曹文诏、黄得功组建的勇卫营成了辽东战场上的两把尖刀。
李邦华，字孟暗，江西吉水盘谷镇谷村人，名言是“我宁为偏枯的学问，不做反复的小人。”
说起这个李邦华有一件非常有趣的事情，万历三十一年他与父亲李廷谏一同中了举人，爷俩互相镞砺，第二年李邦华就考中了进士，当然他老爹落榜了。由于他与东林党人邹元标是同乡，所以上任之初就被贴上了东林党的标签，屡屡遭受排挤，他也不为自己辩解，索性称藏家。
左战登基后启用的第一批人就有他，在朝中挂了个右佥都御史的头衔就到天津做巡抚去了。俗话说是金子在哪里都能发光，他到天津后积极整顿军务，使津门军成为各镇的表率。左战见状立即将他调入兵部任右侍郎，与孙承宗一道成为军事改革的骨干力量。由孙承宗负责培养、选拨年轻的军事将领，开办军事院校，组建关宁铁骑和近代陆军。李邦华则革除军中弊端，惩处贪腐，保证军人的纯洁性和纪律性。
君臣见面自是一阵寒暄，闲扯几句后左战开门见山的问道：
“现在京营整饬的如何了？”
李邦华是个急脾气，立即回道：
“京营一向存在占役、虚冒的情形，臣惩治了十几个老奸巨猾的掾史，要求一年考察两次，目前已基本杜绝这种事情。不过军马只有一万五千匹，经常有官员借用坐班马，甚至折价把马匹买走了，臣建议军马是用来打仗的，以后取消借马的惯例。”
左战见他对症下药，做事讲求快刀斩乱麻，点头后继续问道：
“李爱卿但说无妨，只要是实情朕即刻下旨去办理。”
李邦华知道惺帝喜欢实干家，决定不再兜圈子，直接回道：
“京营每年领取太仆银一万六千两，屯田籽银一千零六十两，可是各级将吏索要无度，臣建议由协理每年支取一千四百两，总督、巡抚等官员依次递减。另外三个预备营可以并入五军、三千、神机营，对于需要升迁的将领按天考察成绩，在每个小营预备一个功劳簿，每月汇总他们的成绩报给协理，择优进行选派。”
这些奏折被左战一一批红，李邦华喜出望外，一时想不起其他的事情来，竟然呆呆的立在那里。左战见状哈哈大笑，调侃的说道：
“想不到能言直谏的孟暗也有说不出话的时候，那朕便替你说了吧！仓场总督南居益说这两年的军粮比万历四十六年增加了近六万石，可是你已裁撤了大量的占役、虚冒编制，按理说应该减少许多才对。这里面的事你尽快查清楚了，更重要的是抓紧拿出个标准出来！”
李邦华没想到惺帝知晓这么多的细节，一时臊得耳根子都红了，有些语塞的回道：
“圣上英明，让臣自惭形秽。京营的实际编制为十二万人，粮饷应以一百四十四万石为定额。不过目前臣只招募到九万七千人，还需要一年的时间才能完成。”
左战见他为人坦诚，知无不答，顿时心生好感，狠了狠心命王安取来那把承影剑，郑重其事的说道：
“这把剑虽然削铁如泥，但在朕手中与朽木无异，今日就赠与你了。你的这些建议朕都准奏，回去后立即执行，若是有人从中阻拦，你就拔出宝剑替朕问问他是奸是邪。”
天子赐剑是古代武将的最高荣誉，李邦华心知这把承影剑是惺帝的心头肉，足见他对军事改革的重视，接过剑后叩首谢恩，立誓不铲除奸邪就用这把剑自刎谢罪。
左战见他过于激动，生怕他整顿军纪用力过猛，补充道：
“孟暗稍安勿躁，是权力滋生的腐败，所以你的重点是建立完善的制度，各司互相监督让奸邪之徒没有施展的空间。
这次军事改革表面上是补充新式火器，训练优秀的骑兵，改变以往的战术打法，其实质是一次国家战略的调整，由以往被动防御变为主动出击。万里长城在朕眼里早已不是防御性的堡垒，而是一张拉开的弓，随时可以将朕的意志射到草原的任何地方。
在以往的战争中，我军劳师远征需要消耗巨额辎重，朝廷入不敷出，百姓积贫积弱。朕决定改变这种作战模式，通过掠夺敌人的牲畜粮草来实现以战养战的战略目标，减轻后勤辎重的压力，提高前线部队的灵活性。”
从王恭厂出来后左战便有了这种想法，目前明朝的军事实力完全可以支撑对外掠夺扩张，所以他才决定放任喀尔喀部的哈尔巴拉继续东进，想通过这次较量检验新战略的可行性。
这种战略调整并非左战穷兵黩武，而是充分吸取了南宋的教训。南宋军队的装备水平和作战能力都非常强，可是长期的防守消磨了将士的意志，也拖垮了朝廷的财政，最终赵氏一族众叛亲离，崖山之后汉族再也没有后退的余地。
万历三大征也是佐证，蒙古、土司、倭寇的作乱虽然具有一定的隐蔽性或是远在千里之外，但以明朝强大的特务机构和驿站系统，这些叛乱的迹象绝对可以第一时间上报到朝廷。那么问题来了，为什么神宗皇帝要等叛乱坐实了才发兵抗击？
其实不光是他，历朝历代的守成之君都不愿意轻言战事，能动口尽量不动手。究其原因还是战争的代价太大，不但从敌人那里得不到好处，还要消耗朝廷的财政，加重农民赋税和徭役，轻则导致国贫民弱，重则动摇统治根基。