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随着宇智波和彦的回归，一道道命令自雷界传递而出，斗破世界的局势开始发生巨大的改变。
最先一步的改变，便是关于陀舍古帝玉碎片的事情。
宇智波和彦原本的计划，是让大长老在今年举办的灵器拍卖会上将它拍卖出去，以此化解魂族暗中谋夺陀舍古帝玉碎片的计划，避免给雷族造成过大的损失。
而在将萧炎和古薰儿等人彻底当做阻拦雷族崛起的绊脚石后，宇智波和彦调整了原本的计划，委托结束闭关的雷赢找到那位被魂族用秘术吞噬取代的长老，当面揭穿了对方的伪装与阴谋。
接下来，雷赢按照宇智波和彦的新计划，并没有将那名魂族内应击杀，而是让他传话给魂族族长魂天帝，希望能够与魂天帝见上一面，商谈一些事情。
当魂天帝得知雷赢的意思后，暗中与雷赢相见，结果发现雷赢不但突破到了九星斗圣，实力竟然不比他逊色多少，当下将雷族放在了与魂族同等级的地位上。
雷赢早就从宇智波和彦那里知道了魂天帝的一切谋划，按照计划与魂天帝进行商讨，最终两族结成结盟关系，并共同制定一个改变世界格局的计划。
远古八族中的灵族已经覆灭，只剩下雷族、魂族、古族、石族、药族、炎族和名存实亡的萧族，所以双方接下来的行动，便是将其他的远古种族逐一剿灭。
第一点，作为双方的磨合行动，目标选择为实力最弱的石族，由双方共同派遣精锐人员，突击石族的总部石界。
在行动的收获方面，魂族可以得到石族的那块陀舍古帝玉碎片玉石族之人的血肉灵魂，而雷族则获得剩下战利品中的七成。
第二点，以魂族为主覆灭药族，雷族派遣一定数量的精锐辅助，一切战利品都归魂族；
第三点，以雷族为主覆灭炎族，魂族派遣一定数量的精锐辅助，一切战利品都归雷族，不过炎族的陀舍古帝玉碎片要交给魂族；
第四点，双方主力尽出，联合摧毁明面上最强的远古种族古族已经萧族的幸存者萧炎，两族的陀舍古帝玉碎片归魂族所有，雷族得到其他战利品的六成。
最后一点，两族以中州中心轴为界，东部归雷族所有，西部归魂族所有，平分斗气大陆。
虽然这样的做法会让雷族壮大，但魂天帝心中最重要的目标，是进入陀舍古帝洞府，希望能够从里面得到突破斗帝的方法，成为如今斗破世界的最强者。
一旦魂天帝能够突破境界成为了斗帝，那么即便雷族的实力超越如今的古族，依旧可以轻而易举的覆灭掉雷族。
正因为如此，魂天帝才会同意与雷族结盟，希望能够尽快收集到剩下的几块陀舍古帝玉碎片，早日寻找到陀舍古帝洞府，参悟出晋级斗帝的奥秘。
宇智波和彦的目的，则是借助魂族的力量，更安全的覆灭其他的远古种族，以免在执行最终计划时，给雷族减少一些不必要的损失。
想要覆灭一个远古种族，是一件相当困难的事情，因此即便是两族联合，也花了大半年的时间进行布局，趁着石族过年团聚、防范戒备之心最弱之时，悍然发动了对石族的覆灭行动。
原本的剧情中，魂族独力便可将石族覆灭，如今有了强化版雷族的参与，灭族过程变得更加轻松，摧枯拉朽般的便将石界里的石族族人尽数击杀，化为魂天帝提升灵魂强度的补品。
石族虽然没落，但瘦死的骆驼比马大，依旧搜刮到价值不菲的战利品，按照约定瓜分之后，双方联手将石界封锁，暂时隐瞒下石族覆灭的消息，以免打草惊蛇，影响到后面的灭族行动。
宇智波和彦利用从石族搜刮到的极品药材，炼制出数枚用来提升修为的丹药，一举突破到合体中期巅峰（六星斗圣）的水准，配合着他掌握的各种神通秘术，综合实力达到了九星斗圣前期的程度。
经过两年时间的休整后，雷族与魂族的计划继续进行，利用药族举办药典的时机，以魂族大军为主力突袭神农山脉，发动对药族的灭族之战。
药族的实力比没落的石族强大，面对魂族的入侵自然是拼尽全力抵抗，可惜魂族早就已经做好了准备，在雷族精锐的辅助下抵御住了药族的反扑。
生死存亡之际，药族族长药丹启动了以前从来没有开启过护族之阵【化天药阵】，召唤出药族的始祖残魂阻拦魂雷两族的联军。
面对恐怖的药帝残魂，魂族请出了负责统领这次行动的虚无吞炎，以上百万药族裔民的生命为代价，击溃那一缕药帝残魂，强势的摧毁了化天药阵。
大阵破碎，残魂消亡，药族也就失去了最后的底牌，在一道道愤慨的自爆声中走向灭亡。
战斗结束后，魂雷两族的联军带着战利品撤离，并在离开前解除了战斗前对神农山脉的空间封锁。
没过多久，药族被灭的消息就传遍了中州，魂雷古炎四族纷纷派遣高层长老前来神农山脉，探查药族被灭的原因。
与此同时，四族的族长也聚集起来，前去封闭起来的灵界与石界，将空间封锁破除后，发现灵族与石族也被未知的敌人给灭族了。
灵石药三大远古种族的灭亡，在中州引起轩然大波，一向行事诡秘的魂族与明面上实力最强的古族，自然就成为了怀疑的对象，于是炎族族长炎烬找到雷赢，提出双方结为战略同盟，防备可能是凶手的魂族与古族。
雷赢自然是知道事情的真相，但还是选择与炎烬结盟，并在获得炎族信任之后，设置了一个绝杀炎族高层人物的陷阱，将炎族高层一网打尽。
之后，雷族大军出动，与前来增援的魂族精锐一同赶往炎界，将群龙无首的炎族从远古八族的行列里抹去。
炎族覆灭的过程中，魂雷二族没有进行过多的掩饰，很快就暴露在古族与其他一些势力的眼中，一时间，整个斗气大陆充斥着一种山雨欲来风满楼的凝重气氛。
ps：本书进入收尾阶段了，新书准备中，暂定为单火影世界的火影同人。