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针对旷日持久的小冰河气候，明朝境内做了最大的努力，几乎每个县都在修建水库、加固大坝、疏通河网。为防止奸商趁机屯集粮食，刑部专门制定了粮食法，以保障国家粮食的安全，维护赈灾粮的流通秩序。此后朱由校又出资设立皇家医学院，汇集天下名医、经典，每逢灾情出现时由朝廷组织医疗队奔赴一线救援。
总之，小冰河气候的影响虽然给中原地区造成了沉重的灾难，但并没有出现混乱的局面，大明的综合国力仍在缓慢的上升。
与明朝不同，周边的其他国家可就没这么好过了。首先是日本，常年的战乱早已荒废了境内的生产，每逢旱涝便会导致粮食绝产，京都的稻米一度比黄金还贵。其次是蒙古草原，由于干旱大片的草场已经枯竭，各部落为了生存下去不惜付诸武力，致使原本就十分脆弱的民族同盟成为一张废纸。
天启十二年，东察哈台汗国在沙俄的支持下攻打土尔扈特部和杜尔伯特部，不但抢夺他们的人口和牲畜，还霸占了他们的传统牧场。两位部落头领眼见族人将面临灭顶之灾，决定合兵一处逃往大明的北海省。面对拒不投降的蒙古牧民，沙俄担心他们到达明朝境内后会找皇帝告状，沿途派出机动性极强的火枪兵进行围追堵截，致使这条求生之路上尸横遍野，惨绝人寰。最后活着进入子卿城的只有不到两万人，还不到原来的三十分之一。
由于这些从地狱里逃出来的幸存者是明朝的藩属，北海巡抚王化贞并不想将他们安置到城内，担心会招致外敌的骚扰。深谙皇帝心思的戚金则不这么认为，他知道从惺帝跨上战马那一刻起，大明的疆域注定会持续扩张，民族同盟只不过是一次小小的尝试，后续还将有更大的战略目标。为此他一面调动卫所的军队阻击沙俄追兵，一面向军机处寄发八百里加急，将具体的情况详细的汇报给朱由校。
面对东察哈台汗国和沙俄的背信弃义，朱由校连夜召集大明精英在勤政殿商议对策。众人见这阵势心中依然明了，各自在座位上低头不语。朱由校见人都到齐，开门见山的说道：
“大明和蒙古草原上的九个部落签署过《卫拉特法典》，在子卿城又成立了民族同盟，就是想汉蒙一家，不再遭受外敌的侵犯。如今罗刹人竟敢公然越过乌拉尔山和里海的国界线，残杀藩属牧民，侵犯北海主权，朕想听听各位爱卿的意见。”
此时的军机处内可谓将星云集，老一代有孙承宗、熊廷弼、朱夔元、袁可立，新生代有洪承畴、卢象升、孙传庭、黄得功、曹文诏，此外还有候补的袁崇焕、毛文龙、陈策、李邦华、高弘图等。
这些人都是久经沙场的将帅之才，堪称大明帝国的军事精英。孙承宗听闻皇帝改回罗刹的称呼，心知这一仗在所难免，附和的回道：
“启奏圣上，《尚书》云：‘天作孽，犹可违；自作孽，不可活’。东察哈台汗国和罗刹既然背弃盟约，我朝就应当依据《卫拉特法典》和民族同盟的约定，率领其他八部盟军进行征讨，否则条约就如同一张废纸，大明的天威已将遭到夷狄的轻视。”
孙传庭身份何等尊贵显赫，众人见他毫不迟疑的支持皇帝的作战计划，心知如今的大明朝一切权力都要围着天子转。孙传庭本就是位好战份子，靠着在关外的军功进入军机处，自从民族同盟成立后他这个宣大总督一直无所事事，如今面对这么好的机会，他火急火燎的抢在孙承宗后面说道：
“圣上，当初大明与蒙古九部在乌兰巴托盟誓，里海、极北境内的国家都是大明的藩属，各部落之间明确边界，不得互相攻击。如今个别部落竟敢挑衅大明的天威，是可忍孰不可忍！末将请命率一支皇家陆军西出乌鲁木齐，直扑贼人的巢穴，以解圣上的心头之恨。”
朱由校见这个愣头青有些拼命三郎的架势，半开玩笑的反问道：
“百雅久在大同，惦记草原怕不是一天两天了吧？”
不等孙传庭回话，朱由校继续补充道：
“朕的心里只装着对江山社稷的责任和中华民族的热爱，不会记恨什么东西，更不会因怒兴兵。塞外的蒙古同胞是中华民族的一支，创立民族同盟、签订法典只是想都能过上好日子。后来讨伐日本、南越也是一样，日本的起源可以追溯到徐福及他带去的五百童男童女，南越的祖先可以说是龙川县尉赵佗，可见天下本是一家。”
朱由校不适时宜的宣传他的种族论，底下人也是顺带着听一听。经过一夜的讨论，军机处决定由袁可立任西征大元帅，陈策、洪承畴、卢象升、孙传庭为副将，各率叶赫骑兵、朵**兵、天雄军以及皇家陆军在肃州卫集结，到达乌鲁木齐后与左光斗的建设兵团合兵一处，然后直扑撒马尔罕。袁崇焕调至兰州负责大军的后勤补给，密切关注藏巴汗的动向。黄得功、曹文诏分别驻守宣府和大同，防止西北发生暴乱。
这次出征可以发现两个问题，一是袁崇焕依然没有受到重用，只是临时做了运输大队长；二是西征军中并没有独立的蒙古骑兵，他们都被零散的安插到大军之中。其中缘由，朱由校有自己的考量。
袁崇焕是历史上争议比较激烈的人物，众家各执一词，但都不否认他一直在抗击女真，称得上是一位民族英雄。只可惜他错杀毛文龙，白白丢掉了可以牵制后金的皮岛，最终导致皇太极可以肆无忌惮的绕道蒙古草原，固若金汤的关宁防线变成一招死棋。在朱由校看来他虽不能攻但善守，远距离奔袭作战并不适合他，当初在讨伐广南阮氏的时候就已经得到印证。
至于为何不设立独立的蒙古骑兵军团，这倒不是朱由校不信任蒙古同胞，实在是巧妇难为无米之炊。民族同盟成立后，内地的货物源源不断的运到草原，这些蒙古贵族纷纷住进子卿、乌兰巴托等城池。
俗话说温柔乡是英雄冢，长年累月的奢靡生活早已消磨掉了黄金家族的斗志，臃肿的身躯再也跨不上矫健的战马。加上明朝强制汉蒙通婚，严厉消灭外来信仰，很多蒙古贵族的子弟与汉人无异，竞相奔赴内地生活，谁还愿意在草原上啃黄沙。