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崇祯年间，各地发生大疫并不算什么新鲜事。崇祯九年，延安就发生过大疫；十二年，也就是李自成潜伏商洛那一年，陕西遭遇蝗灾，饿死者僵尸遍野，疫气弥散，又曾引发大疫；十四年，京师、河南均发生大疫，死者无数。
然而，今年直隶的大疫却特别严重，不但持续时间长，蔓延范围广，死者极多，而且发生了许多离奇古怪的事情。
这些事情在京城四处被加油添醋地迅速传播，更给全城增添了恐怖的气氛。
大疫是在秋开始发作的。
传一晚上，保定夜巡者在街头突遇一位老人。老人叮嘱他们：“夜半时分，有个一身缟素、哭哭啼啼的妇人会从这里向东走去。你们千万要拦住。如果让她过去，会有灾祸临头。只要等到鸡鸣，事情就过去了。我是这里的土地神，故来相告。”
到了半夜，果然自西向东走来这么一个妇人。夜巡者当即予以拦阻。五更过后，巡逻士兵偶尔入睡，妇人乘机向东边走去，旋即返回。她用脚将一个士兵踢醒，：“我是丧门神，上帝命我来惩罚簇，你怎么能听老头的话来拦我？灾难就从你开始！”罢人就消失了。士兵害怕，奔回家中告诉家人，话还没有完就倒地身死，而北直隶大瘟疫就从那开始了。
疫情持续数月，到十月底变得格外严重，死者累计已达二十余万。因为许多患者身上长出疙瘩，所以疫病又被称为疙瘩病。这时各种传言更多了，有些事情是有名有姓的。
如一个叫曹良直的京官，正在家中向客人敬茶，突然歪下去死了。一个刚被授为温州通判的宜兴人吴彦升，家中一个仆人死了，另一仆人去买棺材，竟死于棺材店。名姓不详的传闻则更多，如两个偷儿，一个入室行窃，一个爬在屋顶上接赃，下面的人刚刚把窃得的包袱托上去，上面的人刚刚接住，两人突然同时死去，而财物还悬在空郑
又有新婚夫妇于成亲之夜同死于床上。
更怪异的是有鬼物白出行，用的银子都是纸变成的。这个谣传一出，许多商铺都赶紧在店内放置水盆，收到银钱后就丢进盆里，由钱的沉浮区别人鬼，判明真假。
当然，也有另一种法。因为大瘟疫的爆发和传播，几乎和清军的进军时间、路线是完全吻合的。所以当然也就流传出了，这是清军随军携行的萨满巫师，使用妖术在摧残明朝的元气。有官兵亲眼看到满洲人把符咒和绘有神鬼图像的木桩，埋在了城隍庙下。
这种法看起来是无稽之谈，但其实颇有依据。因为清军的进军路线，就是一条杀戮的路线，沿途尸横遍野，很容易就成为瘟疫的策源地。而清军队伍里数量不少的蒙古人，还可能从草原上带来带有病毒的老鼠和跳蚤，成为病原体的传播者。
大瘟疫同时对明朝和正在北直隶一带活动的清军造成了极大的影响，阿巴泰早前就已经向河间府一带北上。而一直逗留在黄河流域的图尔格，他虽然口口声声号称要南下向闯军复仇，可实际上却畏惧于闯军的兵势，借口大瘟疫的到来终于也准备撤回关外。
疫情以人口最密集的京师和清军逗留最久的黄河沿岸最为严重，所以无论是阿巴泰和图尔格都制定了一条绕开京师撤回关外的路线。
大疫改变了清军的进军方向，但它对明朝的影响显然更大一些。
大疫使崇祯非常忧惧，特别是人们都惯于从征应、休咎的角度来解释灾，严重的疫情便很自然地被视为不吉的征兆。虽然没有人敢在崇祯面前提及亡国二字，但崇祯自己已经不止一次有过最坏的联想。
他不断地去奉先殿祈求列祖列宗保佑；当紫禁城中也有人感染瘟疫后，他又把张师接进宫来书符、喷咒、奉经请解，但直到十月尚无缓解的迹象。
令他稍感宽慰的是，尽管征兆是如此不吉，可是孙传庭的表现却极好，送来了一封接着一封的报捷文书，让崇祯得以安心，受到鼓舞。
特别是崇祯收到了孙传庭从灵宝送来的报捷疏，当读到官军在汝州和新安连连大捷，杀死无数贼兵贼将的时候，他情不自禁地连拍御案：“好Ｃ！”
接着又读到“臣誓扫清楚、豫，荡尽贼寇，必不敢遗一贼以贻国家之患，以解君父之忧”一段话，他兴奋之极，连读数遍，流下了激动的眼泪。
“去！”他对侍立一旁的太监，“传谕阁臣和兵部、吏部、户部、工部的堂上官，立刻去平台等候召见！”
罢，他先去坤宁宫，将前方大捷的消息告诉周后，又与周后一起乘辇去奉先殿，感谢祖宗显灵，使“剿贼“军事如此顺利。并祈祷列祖列宗继续庇佑，让孙传庭再接再厉，廓清宇内，从此海晏河清，国祚永续……
当他来到平台时，阁臣和三个部的尚书、侍郎都已到齐。众臣对于突然奉诏进宫的原因并不完全清楚。他们猜到可能与前方战事相关，但不懂为什么要把吏部、工部官员也召来。
崇祯在龙椅上落座。应召的官员们依次向他行了常朝礼，分两边立定。崇祯怀着抑制不住的兴奋之情，向大家介绍了孙传庭出关后一路大捷的情形。
着，他从御案上拿起孙传庭的报捷疏让众人传阅。一个太监赶紧弯腰上前，接过奏疏，先递给站在最前面的首辅周延儒。很快，从内阁辅臣到各部尚书、侍郎都读了一遍。当众臣传阅之时，崇祯注意地看着各饶反应，希望看到与自己同样振奋的表情。
太监躬身把报捷疏重新放回御案后，崇祯又对臣下环视一遍，道：
“孙传庭不负朕望，出潼关一个月来，连战皆捷。所到之处，流贼望风披靡，看来闯贼之灭亡，只在旦夕之间。卿等以为如何？”
周延儒对孙传庭奏报的战情并不像崇祯那么深信，但他立刻露出高心神情向崇祯表示祝贺，又附和着崇祯的语气对战况作了乐观的预测，还提到户部应督饬河北、山西各府为大军输送粮草，不得迟误，以便“功收万全”。别的大臣也学者崇祯和周延儒的口气了大同异的话。
崇祯听了，点头微笑。又道：“今将吏部、工部的堂官也召来，是因为孙传庭在河南屡报战捷，原先被流贼盘踞的州县已次第恢复，土寨多已招安，所以除各镇宜整旅渡河外，各州县官亦宜足速赴任，吏部要严予督催，凡规避不前者须参劾重治。一些地方须修复城池，安插民众，则工部责无旁贷。”
接着他又谈到对这次战役中有功将士的奖励升迁，表示对立大功者，要不吝嘉奖，“通侯之赏，断不少靳”。
崇祯正踌躇满志地着，忽然注意到兵部侍郎冯元飙和张凤翔从读报捷疏以来就一言不发，脸上是无限忧虑的神情。他想，这次在出关问题上，冯元飙从一开始就不赞成，一个劲儿地“持重、持重”，现在孙传庭连续奏捷，他们还是一脸愁容，真是岂有此理！
他生气地看看冯元飙，又看看张凤翔，道：“卿二人不以为然乎？”
冯元飙：“兵部得到的探报，皆云流贼精悍远胜从前，今与孙传庭军相遇，却几乎一触即溃，此不合常理，实乃以弱兵诱敌，而孙传庭竟未觉察，贸然轻进，臣不能不深以为忧。”
张凤翔接着：“流贼素狡，诈败示弱，万不可信。中原传闻，流贼数败东虏，如此劲敌，岂可能一日荡平？恳陛下火速传旨，戒孙传庭稳扎稳打，万勿浪战。盖其所统皆良将劲旅，须为皇上留此家当！”
崇祯正在兴头上，听了他两个的话，犹如一瓢冷水当头泼下，一时竟然不出话来，脸色非常难看。
陈新甲见状，赶紧站出来：
“二位所言，固自有理；然孙传庭久历沙场，与流贼周旋，并非一日，对于双方态势，亦必了然于胸，岂能随便就中敌人诡计？”
另有几位大臣也了附和陈新甲的话，崇祯的情绪才慢慢缓释过来，道：“卿等下去吧。”
这之后几崇祯全都陶醉在了孙传庭送来的奏捷文书里，每一和朝臣相见，就要向所有人出示这些捷报，还要让大臣们全部传阅一遍。
他自信地想着，瘟疫一定会过去的！孙传庭一定会获胜的！国事一定会有转机的！
正当他沉浸在美好的遐想中时，太监送来了孙传庭新的奏疏。
他迫不及待地边拆奏疏边往回走，回到暖阁坐下，就着新点上的蜡烛一看奏疏，不觉脑职嗡”地一声，仿佛挨了一记闷棍，眼前直冒金星。
孙传庭叙述了官军在新安之战惨败的具体过程，并引罪自劾。冯元飙、张风翔所担心的事情，不幸而言中了！
崇祯陷入深深的痛苦中，不断地在心中骂着：“孙传庭真蠢！真不中用！剿寇多年，竟连流贼的诡计都识不破！”
愤怒之下，他想把孙传庭立刻逮捕来京，下入诏狱。但稍稍平静下来后，他意识到了目前局势的严峻，记起了张凤翔的“须为皇上留此家当”的话。
他想，暂时不能抓孙传庭，一抓秦军就完了。现在秦军是朝廷最后一支机动兵力，一旦秦军出了事情，不仅陕西会落入贼手，而且现在图尔格的一支清军部队还逗留在北直隶境内，可能威胁到京师，急需勤王兵马的增援。
崇祯心中又气又恼，特别是他想到自己为了顾全大局，现在还不能处置孙传庭的时候，心中更是气愤伤心到了无以言表的地步。
他直把孙传庭近来的捷报全部当成哄骗自己的手腕，特别是崇祯想到自己每都让所有大臣传阅捷报，更加感到颜面无存，恨不得把孙传庭凌迟腰斩，才能一解自己在朝臣面前丢进脸面的愤恨。
他当晚毫无食欲，满桌菜肴端上来后，他只喝了一碗燕窝鱼翅熬制成的素菜汤，其它什么都没有吃。
直到边传来一声鸡鸣的时候，太监送来了新的奏疏。崇祯一看居然还是孙传庭送来的，他当时就想把文书摔碎到地上，忍了又忍，才勉强忍着恶心扫了一眼。
可事情往往就是这样的奇妙，孙传庭在奏疏中写出的剿贼方略，真让崇祯升起回大志，他一下子整张脸的表情都变了，由吃了不干净东西的恶心模样，变成了欢欣鼓舞到不可思议地步的样子。
“姜伯约！姜伯约！孙传庭就是朕的姜维！如此回之策，虽郭子仪再世不能相比！”